少時「篤志好學，留心經術」，紹興十二年（1142年）進士，調崇仁尉。宰相陳康伯薦為太學正，守太常博士。孝宗時，遷屯田員外郎，歷官秘閣修撰、直寶文閣、荊南路安撫。官至兵部侍郎。淳熙十五年（1188年）曾與朱熹「論《易》與《西銘》不合」，學術觀點與朱熹迥異，對於林慄的太極、兩儀、四象、八卦之說，朱熹說他「此恐倒說了」。當時朱熹以江西提刑召為兵部郎官，朱熹以足疾辭不赴，淳熙十五年六月，林慄彈劾朱熹「本無學術，徒竊張載、程頤緒餘，為浮誕宗主，謂之道學，妄自推尊」。葉適上書為朱熹辯護。林慄本人精於《周易》，有學者譏其「說每卦必兼互體、約象、覆卦為太泥」，著有《周易經傳集解》32卷、《論語知新》10卷、《林黃中奏議》5卷等書。

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