武德三年（620年），封酆王。玄武門之變前，其母尹德妃為了鞏固地位及自身利益，千方百計巴結討好太子李建成、李元吉，陷害詆毀李世民，而且深怕唐高祖去世後，李元亨無依無靠，因此生母尹德妃與李建成、李元吉通姦，希望李建成、李元吉能關照自己的兒子。貞觀二年（628年），任命為散騎常侍、金州（治所在今陝西安康）刺史。唐太宗作為兄長，思慮弟弟年幼，派遣使者察看弟弟的狀況，賜與金杯。貞觀六年六月十日（632年7月2日），李元亨去世，年僅十四歲，十二月十一日（633年1月26日）下葬。無子，封國除。

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