丁思孔為丁文盛之子，于順治九年（1652年）中進士，選庶吉士，散館授檢討。四遷，授陝西漢羌道副使。康熙二年（1663年）被巡撫賈漢複彈劾，左遷河南開封府同知，後經重新調查，重授直隸通薊道。歷任保定守道、江南布政使及河南巡撫、湖北巡撫。康熙二十二年（1683年）擢偏沅巡撫。康熙二十七年（1688年）任河南巡撫，方才上任，湖北爆發夏逢龍抗清，即移撫湖北，九月，複設湖廣總督，以命思孔。康熙三十三年（1694年）四月，移督雲、貴，期間設水師、賑濟災民。同年八月，卒于任上。