庾蓽是劉宋應州刺史庾深之的兒子，南齊尚書吏部郎庾杲之則是他的侄子。庾蓽十歲時父親被殺，他服喪哀傷得非常瘦弱，獲鄉里稱頌。成年後得州迎主簿，舉薦秀才，擔任安西主簿、尚書殿中郎、驃騎功曹史。庾蓽涉獵不同書籍，有口才。南齊永明年間朝廷與北魏和親，任命他兼任散騎常侍出使北魏，回國後拜授散騎侍郎，主持東宮管記事務。鬱林王蕭昭業時期，庾蓽負責中書詔誥，後來外任荊州別駕，改任西中郎諮議參軍，又再次任職荊州別駕。他秉持法制令地區富庶，又保持節操，拒絕他人請託，清茶淡飯，妻兒免不了饑寒，齊明帝得知後嘉獎他，親自寫下敕文褒美，地方人民都感到光榮。

之後庾蓽遷任司徒諮議參軍、通直散騎常侍；蕭衍平定京邑，建立霸府，任用為驃騎功曹參軍，遷尚書左丞；又外任輔國長史、會稽郡丞、代理郡府事。其時百姓困苦，地方糧食貴達數千，人民流散，他整治安撫當地，又唯廉潔奉公，幾天沒有生火做飯。太守蕭伯游聽聞後饋贈物資給他，他辭謝不受。天監元年（502年）他去世，屍體無法殮葬，靈柩不能入土。武帝得知就下詔賜百匹絹布、五十斛米。當初庾蓽是西楚地方的望族，很早就擔任顯要官位，鄉人樂藹有才能，不滿庾蓽，二人互相競爭。樂藹在齊朝豫章王蕭嶷下任職，蕭嶷去世，樂藹仕途不得志，自步兵校尉求助希望防守荊州，庾蓽時任荊州別駕，忽略樂藹。蕭衍即位，樂藹作為西朝勳獲任名為御史中丞，而庾蓽才代理會稽郡府事，覺得是個恥辱；不久因職內小事被斥責，蕭衍以樂藹為他的同鄉宣旨教誨，庾蓽非常憤慨，因此發病去世。

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