生平

光緒八年（1882年）舉人，報捐道員。先入李鴻章幕僚，後投靠袁世凱，出謀獻策。

光緒二十九年，駐上海幫辦電政大臣，兼招商局總辦。三十年，清商部接收南洋公學，改名高等實業學堂（今交通大學），任監督。三十三年，離招商局，辭職離開高等實業學堂，任農工商部侍郎。宣統三年，遷袁世凱內閣郵傳大臣。

民國二年，得袁世凱支持，入招商局董事會；翌年，當選董事會會長，一任四年。民國五年（1916年），袁世凱稱帝，改元洪憲，楊是主要謀臣之一，並出任郵傳部大臣。袁死後，寓居上海租界。1918年，被其妾毒死。

家庭

有兄楊士驤，官至直隸總督。

楊士琦的兒子楊毓珣民國時曾任山東省省長一職，娶袁世凱的第四女為妻。