道光年間，由內閣貼寫中書，充軍機章京，升侍讀。出為署陝西鳳邠督糧道，咸豐元年（1851年）調直隸永定河道，出任雲南按察使。咸豐二年（1852年）遷廣東布政使，旋擢升為湖北巡撫。次年春，太平軍棄武漢東下，攻克興國州田家鎮，進黃州。他因抗拒失敗，被革職留任。十月，太平軍攻打漢陽、武昌。他與湖廣總督吳文鎔各懷己見。咸豐四年（1854年）正月，吳文鎔兵敗，戰死。太平軍包圍武昌，崇綸自請出城剿賊，計劃脫身逃走避，咸豐帝不許。不久丁憂，青麟代為湖北巡撫，朝廷命崇綸留湖北協防。又以患病為名，請求去職，咸豐帝大怒，將他革職。六月，太平軍攻克武昌前一天逃跑，逃到陝西。曾國藩彈劾，朝廷將他押交刑部，他聞訊在西安服毒自盡。