馬默師從石介，中進士，知須城縣。宋英宗治平年間，以張方平舉薦，為監察御史里行，遇事敢于直言，主張皇帝應獨攬官人之權，以實績進退官吏。治平四年（1067年），宋神宗即位，以論歐陽修事，通判懷州。上疏陳奏十事，改知登州。又請更定《配島法》，沙門島囚犯得全活之人甚多。入朝為三司鹽鐵判官，因與富弼交好，且論新法不便，出知濟州、兗州。轉任廣西轉運使，上奏平蠻方略，以為勝負在將不在兵。宋哲宗元祐初年，召為司農少卿。反對恢復鄉差衙前法，建議提舉常平官歸提刑司。歷任權工部侍郎、戶部侍郎，出為河東轉運使，該改鎮兗州，賑濟流民數萬計。後為寶文閣待制知徐州，告老，改任河北都轉運使。紹聖四年（1097年），以為黨附司馬光落職致仕，元符三年複官。終年八十歲。宋高宗紹興年間，贈開府儀同三司，加贈太保。