正德九年（1514年）登甲戌科進士，授刑部主事。明武宗南巡之爭中，因進諫勸阻而受杖奪俸，隨後引疾歸鄉。此後起用恢復官職，改吏部，歷任吏部考功司郎中。嘉靖二年（1523年）大禮議事件中，廷臣數次進諫，薛蕙亦上疏勸阻。世宗讀後大怒，奪俸三月，此後因事誣陷而歸鄉。