崇禎七年（1634年）出生。方以智次子，與兄方中德、弟方中履皆秉承父學，尤好天文曆算。明朝滅亡，隨父隱居廣東的五嶺。順治八年（1651年），娶陳名夏第三女陳舜英為妻。順治十年（1653年），至南京探親，與梅文鼎、薛鳳祚等數學家友好，並向波蘭學者穆尼閣（Jean Nicolas Smogolenski）學習火星軌道法。曾以數學原理解析《河圖》、《洛書》，認為勾股出自《河圖》，加減乘除出自《洛書》。順治十六年，前往北京，與欽天監正湯若望討論曆算。康熙二十二年（1683年），由佟儼若介紹，前往廣東恩平教書。晚年從學者甚眾。康熙三十七年（1698年）去世。著有《數度衍》二十四卷、《附錄》一卷、《揭方問答》、《音韻切衍》、《篆隸辨從》、《心學宗續編》、《陪翁集》等傳世。有子方正珠、方正瑞、方正繆。

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